全身性真菌感染仍然是艾滋病病毒感染者患病和死亡的主要原因，而普遍注意到表面或不復雜的感染。 與HIV最常有關的機會性真菌感染：
還發現了許多其他真菌感染（包括曲霉病，青黴病和芽生菌病），最常見的是CD4計數低於250個細胞/ mL的個體。
有許多藥物通常用於治療HIV相關的真菌感染。 這些藥物根據其具體的作用機制分類，並可分為四大類：
I. Polyene Antifungals
多烯抗真菌劑通過破壞真菌細胞膜的完整性而起作用，其最終導致細胞死亡。 用於HIV的最常見的多烯抗真菌劑是：
- 兩性黴素B ：通常與治療全身（全身）真菌感染如隱球菌腦膜炎相關。 當兩性黴素B靜脈給藥時，已知具有嚴重的副作用，通常在輸注後不久發生急性反應（例如發熱，寒戰，嚴重，噁心，嘔吐，頭痛和肌肉/關節疼痛）。 因此，兩性黴素B的靜脈內給藥通常在嚴重的免疫功能受損或危重症患者中顯示。 口服製劑可用於治療念珠菌病，這對使用低毒性藥物是安全的。
- 制黴菌素 ：口服或局部用於表面口服，食道和陰道念珠菌病。 制黴菌素還可用作預防性（預防性）治療HIV感染的高風險真菌感染患者（CD4計數為100細胞/ mL或更低）。 制黴菌素可用作片劑，漱口水，軟錠劑，散劑，乳膏劑和軟膏劑。
II。 唑類抗真菌劑
唑類抗真菌劑會中斷維持真菌膜完整性所需的酶的合成，從而抑制真菌的生長能力。 常見的副作用包括皮疹，頭痛，頭暈，噁心，嘔吐，腹瀉，胃痙攣和肝酶升高。
- Diflucan（氟康唑） ：可以說是世界上處方最多的殺真菌劑之一，Diflucan用於治療淺表和全身性真菌感染，包括念珠菌病，隱球菌病，組織胞漿菌病和球孢子菌病。 Diflucan可以片劑形式，口服懸浮液粉劑或靜脈注射用無菌溶液形式提供。
- Nizoral（酮康唑） ：Nizoral是第一種口服唑類抗真菌藥物，但很大程度上已被其他具有較低毒性和更大吸收的唑類取代。 它可以以片劑形式以及用於表面真菌感染包括念珠菌病的各種局部應用。
- Sporanox（伊曲康唑） ：當其他抗真菌劑無效或不適當時，常用於全身感染（如念珠菌病或隱球菌病）。 Sporanox可以膠囊形式或作為口服溶液（被認為在吸收和生物利用度方面優越）。 靜脈製劑在美國已不再可用。由於其對腦脊液的滲透性低，因此在治療隱球菌腦膜炎時，Sporanox通常僅用於二線治療。
其他用於治療機會性真菌感染的唑類是VFend（伏立康唑）和Posanol（泊沙康唑）。
III。 抗代謝藥Antifungal
只有一種抗代謝藥（Ancobon）已知具有抗真菌特性，它通過乾擾RNA和DNA合成來完成。
- Ancobon（flucytosine） ：用於治療嚴重的念珠菌病和隱球菌病，Ancobon總是使用氟康唑和/或兩性黴素B，因為單獨使用時耐藥性的發展很常見。 兩性黴素B和Ancobon的組合已被證明有利於治療隱球菌腦膜炎。 Ancobon以膠囊形式提供。 副作用可能包括胃腸不耐受和骨髓抑制（包括貧血）。 也報導了皮疹，頭痛，意識錯亂，幻覺，鎮靜和肝功能升高。
IV。 棘白菌素
一類新的稱為棘白菌素的抗真菌藥也被用於治療念珠菌病和曲霉病。 棘白菌素通過抑制真菌細胞壁中某些多醣的合成而發揮作用。 一般來說，棘白菌素的毒性較低，藥物相互作用較少，但目前他們更常用於對其他傳統抗真菌藥物不耐受的患者。 所有三種都是靜脈注射，具有相似的安全性，有效性和耐受性。
- Eraxis（anidulafungin）
- Cancidas（卡泊芬淨）
- Mycamine（米卡芬淨）
資料來源：
Marty，F.和Mylonakis，E。“HIV感染中的抗真菌藥物”。 專家意見藥物治療。 2002年2月; 3（2）：91-102。
Mei，H .; Kok，L .; Shariff，M .; 等人。 “HIV病人機會性感染的抗真菌藥物使用：療效和安全性的比較。” WebmedCentral艾滋病。 2011; 2（12）：WMC002674。
美國國立衛生研究院（NIH）。 “ 預防和治療艾滋病毒感染的成年人和青少年機會性感染指南”。 馬里蘭州貝塞斯達; 於2013年9月27日更新。